Nghiên cứu tạo vật liệu ban đầu phục vụ chọn giống tôm thẻ chân trắng (Litopenaeus vannamei) kháng bệnh đốm trắng (WSSV)

Vừa qua, Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản III đã chủ trì và phối hợp cùng chủ nhiệm đề tài ThS. Nguyễn Hữu Hùng đã thực hiện nghiên cứu đề tài “Nghiên cứu tạo vật liệu ban đầu phục vụ chọn giống tôm thẻ chân trắng (Litopenaeus vannamei) kháng bệnh đốm trắng (WSSV)”.
Các giai đoạn phát triển của tôm (tôm bố mẹ, hậu ấu trùng và tôm bắn dấu) ở từng thế hệ chọn giống đều được kiểm soát, phân tích 5 loại bệnh virút gồm: hoại tử gan tụy cấp tính (AHPND), đầu vàng (YHV), hoại tử cơ quan tạo máu (IHHNV), hội chứng taura (TSV) và đốm trắng (WSSV).
Tôm từ thí nghiệm cảm nhiễm được thu và bảo quản trong cồn 70º . ADN từ 10 cá thể tôm của mỗi gia đình (10 mg chân từ mỗi mẫu tôm) được tách chiết bằng Qiagen Dneasy Kit. Hàm lượng ADN được đo bằng máy quang phổ Nanodrop với bước sóng 260 nm. Số lượng copy của virút WSSV trong mẫu tôm cảm nhiễm được xác định bằng phương pháp qPCR theo quy trình Jang et al. (2009). Quy trình q-PCR được thực hiện sử dụng cặp mồi WSSV RT-WSSV-F154 (5′-CCA GTT CAG AAT CGG ACG TT-3′) và RT-WSSV-R154 (5′-AAA GAC GCC TAC CCT GTT GA-3′) để khuếch đại đoạn gen 154 bp. Mồi Taqman được tổng hợp và dán nhãn với thuốc nhuộm huỳnh quang 6-carboxyfloroscein (FAM, fluorophore ở đầu 5’ và N-[4-(4- dimethylamino) phenylazo] benzoic acid (DABCYL; quencher) ở đầu 3’. Số lượng virút WSSV được tính toán bằng so sánh giá trị chu kỳ ngưỡng Ct tương quan với đường chuẩn được thiết lập từ dãy hệ số pha loãng dung dịch WSSV (Phuthaworn et al. 2016).
Sau thời gian nghiên cứu, đề tài đã nghiên cứu tạo được quần đàn tôm chân trắng thế hệ G1 với các thông số di truyền khả quan làm vật liệu ban đầu phục vụ chương trình chọn giống tôm chân trắng kháng bệnh đốm trắng tiếp theo. Đã khuếch đại và giải trình tự 9 đoạn gen trên các gen ALF1, ALF2, AIF, BGB, CAL, HAE, RAB5, P53, TRAF6 liên quan đến tính kháng WSSV ở tôm thẻ chân trắng. Kết quả phân tích mối tương quan giữa tần suất kiểu gen và tính kháng bệnh đốm trắng cho thấy có thể sử dụng các điểm SNP trên gen AIF, ALF1, HAE và Rab5B như chỉ thị trong chọn giống kháng bệnh đốm trắng ở tôm thẻ chân trắng L. vannamei./.
Hồng Anh (TH)
 

Nguồn: Sưu tầm